Il nome Procuratoria di San Marco è stato attribuito alla fabbriceria con Regio Decreto del 9 luglio 1931, in ricordo di una delle più importanti magistrature della Serenissima Repubblica di Venezia (1797).

La Procuratoria di San Marco è governata dal Consiglio di Procuratoria, costituito da sette Procuratori che eleggono dal loro gruppo il Presidente, denominato Primo Procuratore.

Il Consiglio di Procuratoria sceglie e nomina il Proto di San Marco, un ingegnere o architetto a cui è affidata la direzione dei servizi tecnici con mansioni di carattere specifico per la rispettosa conservazione degli edifici e delle loro singole parti attraverso l’impiego dei mezzi più idonei messi a disposizione dalla tecnica, in conformità alle esigenze del culto e alle disposizioni dell’autorità ecclesiastica.

Il Proto è coadiuvato per tutti i compiti e le attività dell’ufficio dall’Ufficio Tecnico, le Maestranze della Basilica e di altri professionisti.